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截止2014年，南京理工大學設有機械工程學院、化工學院、電子工程與光電技術學院等14個專業(yè)學院，在66個本科專業(yè)招生；學校還建有研究生院、繼續(xù)教育學院、國際教育學院，并與合作方聯(lián)合創(chuàng)辦了南京理工大學紫金學院和南京理工大學泰州科技學院兩個獨立學院。 學院設置南京理工大學機械工程學院　　南京理工大學材料科學與工程學院南京理工大學化工學院南京理工大學環(huán)境與生物工程學院南京理工大學電子工程與光電技術學院南京理工大學設計藝術與傳媒學院南京理工大學計算機科學與工程學院南京理工大學國際教育學院南京理工大學經(jīng)濟管理學院南京理工大學能源與動力工程學院南京理工大學自動化學院南京理工大學泰州科技學院南京理工大學理學院南京理工大學繼續(xù)教育學院南京理工大學紫金學院南京理工大學知識產權學院南京理工大學外國語學院南京理工大學研究生院南京理工大學人文與社會科學學院南京理工大學教育實驗學院專業(yè)設置院系專業(yè)化工學院化工與制藥類（高分子材料與工程專業(yè)）

化工與制藥類（安全工程專業(yè)）
化工與制藥類（材料化學專業(yè)）
化工與制藥類（化學工程與工藝專業(yè)）
特種能源技術與工程專業(yè)
化工與制藥類（應用化學專業(yè)）
化工與制藥類（制藥工程專業(yè)） 自動化學院自動化專業(yè)
軌道交通信號與控制專業(yè)
電氣工程及其自動化專業(yè)
智能電網(wǎng)信息工程專業(yè) 外國語學院英語專業(yè)
日語專業(yè) 材料科學與工程學院材料成型及控制工程專業(yè)
材料類（材料科學與工程專業(yè)）
材料類（材料物理專業(yè)）
材料類（納米材料與技術專業(yè)） 能源與動力工程學院能源與動力工程專業(yè)
建筑環(huán)境與能源應用工程專業(yè)
武器發(fā)射工程專業(yè)
新能源科學與工程專業(yè) 電子工程與光電技術學院電子信息類（電子科學與技術專業(yè)）
電子信息類（電子信息工程專業(yè)）
電子信息類（光電信息科學與工程專業(yè)）

探測制導與控制技術專業(yè)
電子信息類（通信工程專業(yè)）
電子信息類（微電子科學與工程專業(yè)）
信息對抗技術專業(yè) 計算機科學與工程學院計算機類（計算機科學與技術專業(yè)）
計算機類（軟件工程專業(yè)）
計算機類（網(wǎng)絡工程專業(yè)） 經(jīng)濟管理學院工商管理類（工商管理專業(yè)）
會計學（財務管理專業(yè)）
經(jīng)濟學類（國際經(jīng)濟與貿易專業(yè)）
會計學（會計學專業(yè)）
經(jīng)濟學類（金融學專業(yè)）
經(jīng)濟學類（經(jīng)濟學專業(yè)）
工商管理類（市場營銷專業(yè)）
信息管理與信息系統(tǒng)專業(yè)
工商管理類（人力資源管理專業(yè)） 設計藝術與傳媒學院工業(yè)設計專業(yè)
廣播電視學專業(yè)
設計學類（視覺傳達設計專業(yè)）
設計學類（環(huán)境設計專業(yè)）
設計學類（產品設計專業(yè)）
機械類（中外合作辦學（工業(yè)設計）） 機械工程學院測控技術與儀器專業(yè)

機械類（車輛工程專業(yè)）
飛行器設計與工程專業(yè)
機械類（工業(yè)工程專業(yè)）
機械類（機械工程專業(yè)）
兵器類（武器系統(tǒng)與工程專業(yè)）
兵器類（裝甲車輛工程專業(yè)）
兵器類（彈藥工程與爆炸技術專業(yè)） 理學院工程力學專業(yè)
數(shù)學與應用數(shù)學專業(yè)
土木工程專業(yè)
信息與計算科學專業(yè)
應用物理學專業(yè)
應用統(tǒng)計學專業(yè) 人文與社會科學學院法學專業(yè)
公共事業(yè)管理專業(yè)
社會工作專業(yè) 環(huán)境與生物工程學院輻射防護與核安全專業(yè)
環(huán)境工程專業(yè)
生物工程專業(yè)
截至2014年，南京理工大學擁有教職工3000余人，其中專任教學科研人員1800余人；其中兩院院士10人（含雙聘），德國科學院院士3人，俄羅斯工程院院士1人，“千人計劃”“國家特聘專家12人，長江學者特聘教授、講座教授11人，“國家杰出青年基金”獲得者7人，“國家級教學名師獎”獲得者3人，國務院學位委員會學科評議組成員3人（其中召集人1人）,“973”首席科學家5人，“國家級有突出貢獻中青年專家”5人，政府特殊津貼獲得者178人；“新世紀百千萬人才工程”入選者11人 ，教育部“新世紀優(yōu)秀人才支持計劃”入選者27人 ，“江蘇特聘教授”5人，國防科技工業(yè)“511人才工程”22人，江蘇省“高層次創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)人才引進計劃”4人，江蘇省“333高層次人才工程”137人，江蘇省高?！扒嗨{工程”80人；教育部“長江學者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃”創(chuàng)新團隊4個 ，國家級教學團隊5個，國防科技創(chuàng)新團隊7個，江蘇省各類創(chuàng)新團隊9個。 兩院院士（全職）李鴻志 王澤山 蘇哲子 楊紹卿 劉怡昕 崔向群 名稱負責人名稱負責人化學工程系列課程教學團隊鐘 秦大學數(shù)學基礎課群教學團隊楊孝平工業(yè)設計教學團隊李亞軍自動控制課群教學團隊吳曉蓓武器系統(tǒng)與工程專業(yè)課群教學團隊錢林方　　 重點學科 截止2014年，學校擁有一級學科國家重點學科2個、二級學科國家重點學科4個（國家重點學科覆蓋的二級學科總數(shù)為9個）；有5個江蘇省優(yōu)勢學科，7個江蘇省一級重點學科，7個工信部重點學科；9個國家級特色專業(yè)，34個江蘇省品牌特色專業(yè)，4個國防重點建設專業(yè)。 學位授予 同期，學校設有14個一級學科博士后流動站，16個一級學科博士學位授權點，30個一級學科碩士學位授權點，具有金融碩士、國際商務碩士、社會工作碩士、翻譯碩士、工程碩士、工商管理碩士（MBA）、公共管理碩士（MPA）、會計碩士、圖書情報碩士、工程管理碩士等10個專業(yè)學位授予點。 重點學科　　級別 學科 國家重點學科 一級學科 二級學科 兵器科學與技術 武器系統(tǒng)與運用工程 兵器發(fā)射理論與技術 火炮、自動武器與彈藥工程 軍事化學與煙火技術 光學工程 　　材料學 　電磁場與微波技術 　應用化學 　模式識別與智能系統(tǒng) 工業(yè)和信息化部重點學科 材料科學與工程 化學工程與技術 光學工程 電子科學與技術 環(huán)境工程 高端裝備設計制造與質量管理 社會公共安全信息工程 江蘇省重點學科 光學工程 機械電子工程 納米材料及相關技術 通信與信息系統(tǒng) 計算機應用技術 工程熱物理 控制理論與控制工程 工業(yè)和信息化部重點專業(yè) 信息與計算科學 信息管理與信息系統(tǒng) 車輛工程 光電信息科學與工程 一級學科博士學位授權點：
兵器科學與技術、儀器科學與技術、控制科學與工程、機械工程、材料科學與工程、光學工程、化學工程與技術、力學、信息與通信工程、電子科學與技術、計算機科學與技術、管理科學與工程、環(huán)境科學與工程、軟件工程、數(shù)學、電子科學與技術。
一級學科碩士學位授權點：
兵器科學與技術、儀器科學與技術、控制科學與工程、機械工程、材料科學與工程、光學工程、化學工程與技術、力學、信息與通信工程、電子科學與技術、生物醫(yī)學工程、化學、動力工程及工程熱物理、安全科學與工程、應用經(jīng)濟學、工商管理、圖書館情報檔案管理、電氣工程、土木工程、設計學、交通運輸工程、物理學、統(tǒng)計學、計算機科學與技術、管理科學與工程、航空宇航科學與技術、環(huán)境科學與工程、軟件工程、數(shù)學、電子科學與技術。 博士后流動站 兵器科學與技術、儀器科學與技術、控制科學與工程、機械工程、材料科學與工程、光學工程、化學工程與技術、力學、信息與通信工程、電子科學與技術、計算機科學與技術、管理科學與工程、航空宇航科學與技術、環(huán)境科學與工程。 學科評估 教育部第三輪全國高校學科評估結果發(fā)布，南京理工大學共有14個學科參評，3個學科排在前10位，其中，兵器科學與技術排在第1位。 代碼 學科名稱 排名 代碼學科名稱排名0826 兵器科學與技術 1 0802機械工程290803 光學工程 8 1201管理科學與工程330817 化學工程與技術 10 0812計算機科學與技術380811 控制科學與工程 11 0835軟件工程420801 力學 17 0305馬克思主義理論560809 電子科學與技術 17 0502外國語言文學660805 材料科學與工程 23 　　　 為推進教育國際化進程，南京理工大學先后與包括世界一流大學在內的近百所海外高校建立了密切的合作關系，開展各類交流合作。經(jīng)國家教育部批準，與美國卡內基梅隆大學舉辦了中外合作辦學項目，培養(yǎng)機器人專業(yè)碩士研究生；與德國慕尼黑工業(yè)大學等30多所海外知名高校簽署了聯(lián)合培養(yǎng)人才協(xié)議，每年選派300多名學生到海外短期學習交流或攻讀學位。
南京理工大學注重與境外高水平大學和科研機構開展科研合作，先后與德國卡爾斯魯厄理工學院建立了格萊特納米科技研究所，與法國里爾科技大學、俄羅斯烏法航空技術大學、白俄羅斯戈梅立國立大學等多所高校和科研機構建立了聯(lián)合研究中心或實驗室，每年來校開展合作研究、講學等學術交流活動的境外專家學者達400人次之多。
南京理工大學于1994年成立了由多家政府機構和企事業(yè)單位組成的南京理工大學董事會，學校與董事單位形成深層次、長期穩(wěn)定的合作關系，互利互惠、相互支持，實現(xiàn)了校企相互促進與和諧發(fā)展。為拓寬籌措辦學資金渠道，凝聚各方興學力量，學校于2006年成立了教育發(fā)展基金會，支持學校在人才培養(yǎng)、科學研究和社會服務領域不斷追求卓越。